1中山大学生命科学学院, 广州, 510275; 2广东省农业科学院作物研究所, 广州, 510640; 3广东省作物遗传育种重点实验室, 广州, 510640
*两位作者对本研究贡献相同
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 42 篇
收稿日期: 2015年11月16日 接受日期: 2016年01月25日 发表日期: 2016年01月10日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 42 篇
收稿日期: 2015年11月16日 接受日期: 2016年01月25日 发表日期: 2016年01月10日
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摘 要
Shrunken2基因编码葡萄糖焦磷酸化酶的大亚基,是玉米淀粉合成途径中的限速酶,shrunken2是Shrunken2的隐性突变等位基因,对甜玉米品质和风味的形成起着重要的作用。本研究以玉米B73的Shrunken2基因为参考序列,在58份甜玉米自交系中进行shrunken2基因的重测序,共获得了7 635 bp的核苷酸序列,涵盖了20个外显子,17个内含子以及3’UTR区域。基因多态性分析发现,在供试群体中共有多态性位点105个,包括78个SNP和27个Indel。与普通玉米B73的Shrunken2序列之间存在58个多态性位点差异,包括50个SNP和8个Indel,其中位于编码区的SNP位点包含2个同义突变和7个非同义突变。根据shrunken2基因全长序列和编码区序列可将该群体分成14种和4种单倍型。中性检测表明该基因经历了自然和人工双重选择过程。
关键词
甜玉米;shrunken2;序列多态性;中性检测;单倍型